O sistema bancário rural tem prestado apoio aos agricultores e ajudado no desenvolvimento rural, direta e indiretamente. Com isso, os agricultores podem agora aproveitar o crédito a taxas de juro baratas das fontes formais de crédito rural. Também ajudou os agricultores a aumentar a produção agrícola e não agrícola, o rendimento e o emprego nas zonas rurais. Além destes benefícios, a estrutura de crédito agrícola da economia enfrenta muitos problemas. Alguns desses problemas incluem:
Insuficiência: Em comparação com a procura de crédito rural, o seu volume na Índia ainda é insuficiente.
Cobertura Inadequada de Fontes Institucionais: Como os acordos de crédito institucional não conseguiram cobrir os agricultores rurais do país, continuam a ser inadequados.
Montante Inadequado de Sanção: Além dos acordos de crédito, o montante sancionado pelas fontes de crédito rural é inadequado, pelo que os agricultores desviam os empréstimos para diversos fins improdutivos. Como resultado, o objetivo básico desses tipos de empréstimos fica diluído.
Menos atenção aos agricultores pobres ou marginais: No sistema bancário rural, as necessidades de crédito dos agricultores pobres ou marginais têm recebido menos atenção. É porque a procura de crédito por parte destes agricultores necessitados é rejeitada pelos bancos e outras fontes institucionais, uma vez que não têm garantias. No entanto, devido à melhor qualidade de crédito, os agricultores abastados recebem mais atenção.